Hola, antes que nada disculpa la demora, es que tuve un pequeño problema de salud que me impidió estar online por estos días.

Te comento como funciona el sistema de módulos integrados al layout de iJoomla News Portal.
En el Layout Manager tenés tres opciones: Home Page, Section Page y Category Page. Cada una de ellas tiene un código HTML con tags que permiten mostrar el contenido de tu sitio de diferentes maneras.
Los siguientes tags te permitirán mostrar posiciones de módulos:
{module_position1} - {module_position2} - {module_position3}
Por si solos no muestran nada, sin embargo, si vas a Zones Manager puedes editar cada uno de ellos y asignar la posición que quieras y la cantidad de módulos de esa posición que se mostrarán.
Ejemplo:
Supongamos que en USER5 tienes publicado el módulo de ULTIMAS NOTICIAS y en USER6 tienes publicado el de NOTICIAS MÁS LEIDAS y a ambos módulos deseas mostrarlos en el Home Page dentro de tu iJoomla News Portal pero no en Section Page ni en Category Page.
Lo primero que debes hacer es editar estos tres layout (Home, Section y Category) y en Home Page dejar todos los tags y en Section y Category quitar los tags {module_position1} - {module_position2} para que no se muestren.
Luego vas a Zones Manager y editas Module Position #1 eligiendo USER5 y 1; después editas Module Position #2 y eliges USER6 y 1.
Con esto, cuando vayas al Home Page de tu iJoomla News Portal vas a ver las últimas noticias y las más leídas en la posición que les asignaste.
En tu caso particular, en vez de publicar las últimas noticias y las más leídas publicarías un módulo con banners. El procedimiento es exactamente el mismo solo que eliges la posición en donde está publicado tu módulo con banner.
Saludos,